1. 新たなる砦

税関職員・森万智（趣里）をはじめ、空港の各部署からメンバーが集められた新設部署「GATE24」――。近年の国際犯罪の巧妙化や訪日外国人の急増により空港の入管や税関の現場が困難を極める中、迅速かつ一括対応を可能にするべく縦割りの構造を排除した内閣官房直属のスペシャルユニットとして誕生したのだが…。

2. 爆破予告

税関職員・森万智（趣里）たちGATE24が業務を終えようとしていた時、空港に爆破予告が入る。犯人の要求は、ローマ行きの飛行機に仕掛けた爆弾を解除する代わりに深夜０時までに300万ドルを用意しろというもの。そのため、急きょ爆弾が仕掛けられたとされる飛行機は欠航され、この便に乗り継ぎ予定だった乗客は一時入国すること になり、GATE24が対応することに。

3. スーパーダディ

税関職員・森万智（趣里）は審査していた乗客の腹部に違和感を抱き調べようとしたところ、その人物が隠し持っていた、メルシアウサギが突じょ脱走！ 感染症を持っている可能性もあることからGATE24の審査ブースは急きょ封鎖される。メルシアウサギの大捜索が行われる中、乗客たちを別のブースに案内するが、幼い子ども・ルイス（柊エタニエル）を連れた篠宮文佳（凰稀かなめ）が移動を拒む。

4. 花火

人気韓国アイドルグループ・Hi-Fi Un!cornが１年ぶりの来日公演のため空港に到着。ところがVIP専用ルートのシステムトラブルで、急きょGATE24の審査ブースで対応することに。同じ便の一般乗客たちを待たせる中、税関職員・森万智（趣里）、入国審査官・早見圭一郎（眞栄田郷敦）、税関職員・松山篤志（板垣李光人）たちGATE24はHi-Fi Un! corn一行の入国手続きを始めようとしたところ、万智がひとりの女性から声をかけられる。

5. 我々の仕事

チャトワン共和国から来日した女子大学生のアミタ・バラッドが、入国した翌日に殺害される事件が発生。入国時の様子などを聞く名目で、警視庁捜査一課の西田幸三（内村遥）がGATE24を訪ねてくる。すると、西田はまず税関職員・松山篤志（板垣李光人）に話を聞きたいと指名。アミタが入国する際、入国審査官・早見圭一郎（眞栄 田郷敦）と松山が審査を担当していた。

6. ノー・モア・ベット

首席審査官・深澤然（柳葉敏郎）の機転により、警視庁国際犯罪対策課・井内崇也（吹越満）らが追っていた違法カジノの摘発に一役買ったGATE24。しかし、井内によると胴元側の女性が一人、現在も逃走中だという。さらに摘発により新たな情報をつかんだ警視庁から、近々、関東国際空港を経由して数億円規模の違法薬物が日本へ持 ち込まれる可能性があると連絡を受ける。

7. 奪回

空港周辺は記録的豪雨に見舞われ、ほとんどの便が欠航となる中、《GATE24》はユナイティア連邦から到着した最終便の審査に追われていた。税関職員・森万智（趣里）と入管職員・早見圭一郎（眞栄田郷敦）のブースに現れたのは、実業家・都築燈子（真飛聖）とユナイティア連邦出身の研修医・ルカ。２人は恋人同士で、ルカは日本 で医師免許取得を目指して留学するために来日したというが、気になる点があったため、万智と早見は詳しく検査をすることに。

8. スパイを探せ

入国審査官・早見圭一郎（眞栄田郷敦）は法務省の元上司・有間孝明（西原誠吾）から極秘の連絡を受ける。有間によると、GATE24開設以来、テロリストや過激派の関係者など海外の不穏分子の入国が急増しており、GATE24にスパイがいる可能性があるというのだ。そのため、早見にスパイを探るよう要請。偶然、この会話を聞いてしまっ た税関職員・森万智（趣里）は、GATE24の中にスパイがいるとは到底思えず、その疑いを晴らすためにも早見と共にメンバーを注視することに。

9. ようこそ日本へ

アストリアの反政府組織「民の翼」のメンバーだったことが暴かれた、城崎和雄（勝村政信）の荷物から参事官・杉原美都里（松雪泰子）の名刺が見つかり、美都里の反政府組織「民の翼」との関与疑惑が浮上。事情聴取の結果次第では、GATE24の存続までも危ぶまれる事態に！ しかし、税関職員・森万智（趣里）は美都里の名刺からある真実を見抜き、事態は好転したかに見えたが…!?