1. 賦露楼寓

妖邪界の襲撃から35年、ナスティ柳生を中心に発足した「防衛特殊事案対策本部」通称DSTは、防衛力の強化と次世代を担うサムライトルーパーの育成に尽力していた。再び妖邪界が侵攻してくるかもしれないその日に備えて……。 そしてついにその日がやってきた。突如妖邪界と人間界を繋ぐ門が現れ、妖邪による人間界への侵攻が始まる。北条武蔵ら現サムライトルーパーたちはこの有事に勇敢に立ち向かう。 しかし、懐メロを口ずさむ残忍な妖邪には全く歯が立たず……。

2. 阿亜魔亜

上杉魁人は祖母の芳江を殺した妖邪の後を追う中で武装ギアを盗み出す。その後、祖母を弔うために向かった火葬場で居場所のない死者たちが“カイライ”となり魁人に襲いかかってきた。他の生存者を守るためアンダーギアになって戦おうとするも、人間だったカイライたちを前に攻撃を躊躇ってしまう。そこに織田龍成と凱が現れ て共闘を始めるが、十勇士のネヅも現れて――。

3. 璃无駆

新たにサムライトルーパーの一員となった魁人。と、勝手に加わった北条大和。新メンバーを迎えた凱たちはサムライトルーパーとなるための特訓を開始する。しかし熱意十分で参加した大和はアンダーギアにすらなることができない。そんな歯がゆい状況で十勇士のサイゾウとカマノスケが攻めてくる。特訓の成果を見せる凱たちを 前になす術もなく見ているだけの大和は、かつて自分たちを助けてくれたヒーローの言葉を思い出して――。

4. 魂伐闘

それぞれがヨロイギアを発動し、新生サムライトルーパーとしての形が出来始めた凱たちの前に、突如現れた元サムライトルーパーの石田紫音。「妖邪もトルーパーも俺が無双してやるよ」と言い切り、独自に開発したパワードスーツを纏う青年は敵か味方か。そんな中で龍成が原因不明の毒により倒れてしまう。俺の邪魔をするなと 龍成を突き放した紫音は単独で妖邪界への戸を叩く――。

5. 刺怒根主

遂に凱たちの前に姿を現した妖邪帝王、羅真我。その圧倒的な力の前に凱たちは近付くことすら出来ない。窮地に立たされた凱たちの前に龍成が遅れて駆けつけて、紫音と共にサムライトルーパーは反撃を開始する。そして羅真我を守る結界を突破し、羅真我と凱たちが対峙する。親父を倒す絶好の好機を凱は活かすことが出来るのか ――。

6. 離守舵跡

羅真我は凱たちに対して、７日間の猶予を与えるという。凱が大人しく羅真我のカイライとなるか、代わりのカイライを見つけるかの選択を迫られる中、魁人たちは龍成を失った悲しみと戦いの非情さに打ちひしがれていた。紫音は龍成が遺した想いをひとりで背負い、「俺が新生サムライトルーパーを創る」と要塞列車を乗っ取って ――。

7. 冥喪裏威

羅真我を倒せるという伝説の鎧“覇皇帝”の情報を持つ山野純は、少年の頃の写真とは似ても似つかない姿となっていた。覇皇帝完成のためには覇道の鏡を手に入れる必要があり、紫音が新たに加わった新生サムライトルーパーが鏡を探しに調査に向かう。そこは大和と武蔵が幼少期を過ごした児童養護施設。二人は施設長と数年振り の再会を果たすが、記憶と異なる温和な対応に武蔵は違和感を抱き――。

8. 逢解寅

宇治原施設長の遺した衝撃の事実により、魁人は自身の境遇をうまく受け入れられずにいた。そんな中、覇皇帝の完成にはただ三種の神器を揃えるだけでは足りず、制覇の剣が本来の輝きを取り戻す必要があるという。そのためにある聖獣の力が必要だと知った凱たちは、純と共に聖獣を探すため動物園を訪れるが、カイライたちが不 気味に目を覚まして――。

9. 鵶迂斗武霊苦

ナスティは秘密裏に何者かと繋がっていた！ その謀略により紫音は断腸の思いで傷ついた仲間たちを妖邪界に残してしまったことに、やり場のない怒りを感じる。一方、次々と犠牲になる十勇士の苗字組たち。残りのカケイとモチヅキは遂に反旗を翻す。そして約束された期日を迎え、妖邪城へと乗りこむ凱たちの前に立ちはだかるのは――。

10. 錯利符愛棲

妖邪城に突入した凱たちの前に現れた５つの門。羅真我は美麗を人質に奥義習得のための試練を５人に与える。そして門の先の世界で待ち構えていた十勇士は「仁義礼智信」の心を凱たちに問う。正義とは何か。戦う理由とは何か。美麗を救うために奮起する凱たちは奥義を習得して覇皇帝を発動することが出来るのか――。

11. 履陀鞍

遂に覇皇帝を発動させ、圧倒的な力で残酷な運命を乗り越える凱たち。犠牲になった仲間を想い、自分たちの戦いに疑問を抱き始めるサスケ。羅真我を目前にした凱たちに突き付けられる35年前の衝撃の事実。そして盛大な宴の幕が開き、羅真我との直接対決が始まる――。

12. 恵緋浪愚

凱と真田遼。灼熱と烈火。二人の炎の使者が並び立ち、念願の覇皇帝を手にした羅真我と対峙する。サムライトルーパーに最凶の覇皇帝に対抗しうる力は残されているのか――。鎧が照らす！闇夜を照らす！若き五人のサムライたちが最終決戦に挑む！

13. シンショウ

凱が身を挺して妖邪の乱に終止符を打ってから3ヶ月。DSTではナスティに代わり新たな司令官が就任し、壊滅状態にあった東京も復興の兆しを見せていた。人々が平和を享受する中で、ただ魁人たちだけが凱の不在に物足りなさを感じていた。しかし、都内上空に再び異変が訪れて、妖邪の再来を予感させる。そして魁人たちは原因を 突き止めるために妖邪界に向かい、死滅の泉にて石化した凱を見つけて――。

14. キセキ

今度は人間界と妖邪界を滅ぼすために現れた天導界のインメイ。その傍らには天導界の衣装を身に纏う龍成。そして凱の肉体を奪って復活した羅真我はインメイと龍成に対して矛先を向け、戦いは混戦模様を極めていく。龍成が魁人たちに向ける冷たい眼差しの真意とは。突き付けられた現実に彼らは何を選択するのか――。

15. キョウエン

再び覇皇帝を纏い、魁人たちの前に帰ってきた凱ヒーロー。妖邪界を制圧するという目的を果たしたインメイは強力な天業てんぎょうを放ち、龍成と共に去っていく。崩壊する妖邪界から逃げるトルーパーと十勇士。人間界に戻ると、今度は天導界から現れた四獣士よんじゅうしのゴメイ、シメイ、ガイメイが彼らの前に立ちはだかる 。覇皇帝を返してもらいに来たという四獣士に苦戦を強いられる凱たちだったが、どこからか凱に話かける声が聞こえて――。

16. コウボウ

17. センコウ

人間の生命力を吸収して漆黒に染まった覇皇帝は凱を苦しめる。インメイを前にして窮地に陥った凱を救ったのは敵対していたはずの龍成だった。インメイを背後から貫いた龍成の真意とは――。そして天導界では真の覇皇帝完成に必要な覇業の盾の捜索が始まる。それぞれの思惑が交錯する中、戦いの行方は思わぬ方向へ――。

18. サイキ

インメイを滅ぼすために龍成の代わりに命をなげうった紫音。その想いを受け継ぎ再び閃光の鎧を纏った龍成。再び発動した覇皇帝は覇者の勾玉の力を跳ね返し、インメイの撃退に成功する。しかしその代償はあまりにも大きく、勝利を喜ぶものは誰もいなかった。それぞれが喪失感に打ちひしがれる中、助言を求めてナスティの元を 訪れた凱は、戦いの前に紫音がナスティを訪れていたことを知る。そこで語られた紫音の想いとは。そして再び立ち上がる凱たちが選ぶ答えとは――。

19. トウカイ

紫音の想いを背負い、紫音の分まで戦う覚悟を決めた凱たちはガイメイが召喚した怪物を圧倒し、第一の関所の門番であるガイメイとの戦闘が始まる。驚異的な力を前に劣勢を強いられ、窮地に陥った凱たちの前に駆け付けたサスケたち。奥義習得のために訓練を続けていた彼らは本当の意味でヒーローになれるのか。そして奥義を発 動できるのか――。

20. シメイ

奥義を習得したサスケたちの活躍によりガイメイを倒し、一体感が生まれ始めた凱たちは羅真我の暗躍によって二手に分断されてしまう。魁人たちが捕らわれた第二の関所では四獣士の紅一点・シメイが立ちふさがり、凱不在での戦いという試練を強いられる。一方サイゾウたちは再び凱の身体を奪った羅真我と対峙する。ガイメイの 胸の水晶を奪ったインメイ。身を削りながら計画を推し進めるサグメ。それぞれの思惑を胸に、真の覇皇帝を賭けたかつてないサバイバルが幕を開ける――。

21. ケイコク

インメイに導かれるようにサイゾウたちの元へ向かったサスケが見つけたのは、かけがえのない仲間たちの変わり果てた姿だった。暴虐の限りを尽くす羅真我に激昂するサスケは一騎打ちを挑む。インメイはゴメイの受け持つ関所に現れ、最後の水晶を手に入れようとする。サグメは奪った人間の精気で力を取り戻し、自らに課した使 命のために立ち上がる。そんな中、凱と十勇士の身を案じる魁人たちに待ち受けていたのは――。

22. アイ

十勇士の命と引き換えに覇業の盾が完成し、野望の実現が近付く羅真我。サグメはその野望を打ち砕くため、ヤトゴジンの強大な力をもって羅真我へ戦いを挑む。一方、凱の精神世界で目を覚ました魁人たちは凱の復活のために奮闘する。そこで明かされるサグメの真意と凱の出自。激しい戦いは最終局面を迎え、魁人たちは真の覇皇 帝の完成のために極限の選択を迫られて――。

23. シン

最後の水晶を取り込み最終形態となったインメイは無情にも凱とサグメの親子の再会の時間を奪った。自身の出自と母の愛を思い出した凱は覇業の盾を装備し、真の覇皇帝を完成させる。インメイは破壊の神・ヤトゴジンを復活させ、真の覇皇帝を巡る最後の戦いの幕が開ける。凱たちは死力を尽くして立ち向かうが、圧倒的な力を前 にくじけかけたその時、どこからか凱たちに声が届く――。

24. ガイ